初建於1924年,於1936年重建。嗇色園早年的建築都依據仙師乩示,按五行屬性的佈局而興建。銅亭在1989年重修落成,內外四周皆鑲嵌上銅片,屬於五行中的「金」格局,為香港第一座銅亭,門頂掛有大仙乩筆「飛鸞臺」三字,據說該處早年曾是「扶乩」的神壇,現時已被弟子視作為黃大仙師的静室,室內除供奉黃大仙師外,亦供奉有「朝陽得道啟善菩薩」。頂部四周更掛有《黃大仙寶經》的經文書法,門外對聯「修善果可登斯門 存險心勿到此地」,實在發人深省。

黃大仙祠建築配合「五行」而建,謂之五形。即是以「飛鸞台」建築物為金形、「經堂」為木形、「玉液池」為水形、「盂香亭」為火形、「照壁」為土形,金、木、水、火、土五行俱全。